12月1日，第16届蛋白质结构预测国际竞赛（casp16）结果公布，山东大学数学与交叉科学研究中心杨建益团队取得佳绩，在蛋白质结构域预测赛道中包揽前三名，在蛋白质复合物以及rna结构的自动预测赛道中均获第一名。
图1 蛋白质结构域预测结果的k8体育官网排名（共110个参赛方法）
casp比赛是全球蛋白质结构预测领域最具权威性的竞赛，被誉为该领域的“奥林匹克竞赛”，对于检验算法性能具有重要的指导意义。首届casp比赛由国际著名计算生物学家john moult等人在1994年发起，每两年一届，目前已举办16届，已为相关领域提供了大量可靠的结构预测算法。历届参赛者包括2024年的诺贝尔化学奖获得者david baker、john jumper与demis hassabis。
2024年5月，组委会发起了第16届casp竞赛，要求参赛团队在3天(服务器组)或21天(人工组)内提交预测模型，比赛持续3个月。随后组委会基于实验解析的结构对这些模型进行系统评估和比较分析。本届比赛共有来自美国华盛顿大学、美国密歇根大学、新加坡国立大学、韩国首尔国立大学、丹麦哥本哈根大学、山东大学、华中科技大学、中国科学院计算所、清华大学等单位的209个团队参赛，设有156个蛋白质结构域预测目标、52个rna预测目标，由于这些目标的实验结构在比赛期间尚未公布，比赛属于盲测实验（blind test）。
杨建益教授与团队的王文恺博士（“博新计划”入选者）受邀做大会报告，基于团队开发的trrosettax2和trrosettarna等方法，分别介绍了蛋白质与rna的预测方法与结果，指出尽管蛋白质结构预测的精度已经达到较高水平，但复合物及rna的准确预测仍具有很大挑战性。山东大学团队将继续在这一领域深入研究，利用数学、人工智能和生命科学等多学科交叉的力量，为生物医药等领域提供更为先进的算法。
微信公众号
